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绍兴市首批临床医学重点学科，设有浙大二院蔡建庭教授专家工作站，学科带头人项利娟主任为绍兴市医学会消化内镜分会主任委员。科室熟练开展消化系统常见病和疑难病的诊治及各种消化内镜下诊断和治疗，如消化道息肉切除术，消化道早癌的筛查及内镜下治疗，内镜下内痔套扎术，内镜下介入诊断和治疗。其中，早期胃癌检出率处国内领先水平，内镜黏膜下剥离术（ESD）技术病例数排名全省三级医院第4名。